Susanne E. Ulbrich: Catalogue data in Autumn Semester 2017

Name Prof. Dr. Susanne E. Ulbrich
FieldAnimal Physiology
Address
Professur für Tierphysiologie
ETH Zürich, LFW B 57.1
Universitätstrasse 2
8092 Zürich
SWITZERLAND
Telephone+41 44 632 27 21
E-mailsusanne.ulbrich@usys.ethz.ch
URLhttps://usys.ethz.ch/en/people/profile.susanne-ulbrich.html
DepartmentEnvironmental Systems Science
RelationshipFull Professor

NumberTitleECTSHoursLecturers
751-0206-00LApplied Laboratory Techniques in Agricultural Sciences
The maximum number of participants is limited to 32. Please note, places are given on a first-come, first-served basis. Some parts of the course will be taught in English.

This course will only be offered this semester for Master students (Reglement 2016).
4 creditsB. Studer, N. Buchmann, M. Kreuzer, B. McDonald, S. Neuenschwander, S. E. Ulbrich, A. Walter
AbstractDie Lehrveranstaltung ist zweiteilig aus einem Laborpraktikum und einem angewandten Methodentraining aufgebaut. Im Laborpraktikum werden an 6 Kurstagen die wichtigsten Techniken der Molekularbiologie gelehrt. Das folgende Methodentraining findet an 5 Kurstagen im Bock in einer der beteiligten Forschungsgruppen statt, um die wichtigsten Methoden aus dem jeweiligen Fachgebiet praxisnah anzuwenden.
Objective- Aneignung von guter Laborpraxis (Sicherheit, Effizienz, Qualität und Dokumentation)

- Erlernen der wichtigsten Labor- und Feldmethoden in Agrarwissenschaften sowie deren korrekte und sichere Anwendung

- Vertieftes Verständnis von molekularen, physiologischen und biochemischen Prozessen in aktuellen agrarwissenschaftlichen Themenbereichen

- Aneignung von Kompetenzen für zukünftige Bachelor-, Master-, und Doktorarbeiten

- Kritische Beurteilung der angewandten Methoden für verantwortungsvolle Forschung
ContentMolekularbiologisches Laborpraktikum: DNA Extraktion, DNA Quantifizierung, PCR, Molekulare Marker, Gelelektrophorese, DNA Sequenzierung, Bioinformatik, qPCR

Angewandtes Methodentraining: Inhalte definiert durch die jeweiligen Arbeitsgruppen
Lecture notesLaborjournal
LiteratureWird einsprechend den Kursinhalten abgegeben.
Prerequisites / NoticeDiese neue Lehrveranstaltung ist auf max 32 Teilnehmende im Herbstsemester 2017 limitiert.
751-6003-00LTraining Course in Research Groups (Large) Restricted registration - show details 6 credits13PM. Kreuzer, R. Mandel, E. Mandel, S. Neuenschwander, H. Pausch, S. E. Ulbrich
AbstractThe students will learn the conceptual and methodological background of research in the animal science groups of the Institute of Plant, Animal and Agroecosystem Science. In addition to teaching the theoretical background, the major aim of the course is to integrate the students into the research groups (on job training) and, hence, to focus on the practical application of the knowledge.
Objective- Introduction into the conceptual and methodological basis of research
- Integration of the students into the research groups (on job training)
- Application of the gained knowledge
ContentThe students will be integrated into the research groups’ day-to-day work and will thus deal with all aspects of scientific work. This comprises the planning (conceptually and logistically), execution (data collection, laboratory analyses) and evaluation (statistics, data presentation) of experiments as well as the basics of scientific writing (aim: later publication, Master thesis). The research topics and the range of methodologies vary between the animal science research groups in the Institute of Plant, Animal and Agroecosystem Sciences.
Lecture notesNone
LiteratureSpecific readings after enlisting in a particular research group.
Prerequisites / NoticeThe number of training slots in the various groups is limited. It is therefore highly recommended to contact the group leaders early enough (first come first serve).
The full integration in a research group often means to work on weekends.
The total time budget is equivalent to about 180 hours. Active participation in group meetings (discussion, presentation) and short written reports about the work conducted are required for the 6 credit points. There are no grades, it is only pass or fail.
751-6003-01LTraining Course in Research Groups (Small) Restricted registration - show details 3 credits6PM. Kreuzer, R. Mandel, E. Mandel, S. Neuenschwander, H. Pausch, S. E. Ulbrich
AbstractThe students will learn the conceptual and methodological background of research in the animal science groups of the Institute of Plant, Animal and Agroecosystem Science. In addition to teaching the theoretical background, the major aim of the course is to integrate the students into the research groups (on job training) and, hence, to focus on the practical application of the knowledge.
Objective- Introduction into the conceptual and methodological basis of research
- Integration of the students into the research groups (on job training)
- Application of the gained knowledge
ContentThe students will be integrated into the research groups’ day-to-day work and will thus deal with all aspects of scientific work. This comprises the planning (conceptually and logistically), execution (data collection, laboratory analyses) and evaluation (statistics, data presentation) of experiments as well as the basics of scientific writing (aim: later publication, Master thesis). The research topics and the range of methodologies vary between the animal science research groups in the Institute of Plant, Animal and Agroecosystem Sciences.
Lecture notesNone
LiteratureSpecific readings after enlisting in a particular research group.
Prerequisites / NoticeThe number of training slots in the various groups is limited. It is therefore highly recommended to contact the group leaders early enough (first come first serve).
The full integration in a research group often means to work on weekends.
The total time budget is equivalent to about 90 hours. Active participation in group meetings (discussion, presentation) and short written reports about the work conducted are required for the 3 credit points. There are no grades, it is only pass or fail.
751-6101-00LAnatomy and Physiology of Man and Animals I2 credits2VM. C. Härdi-Landerer, S. E. Ulbrich
AbstractImparts a basic understanding of physiology an anatomy in man and domestic animals, focusing on the interrelations between morphology and function of the organism, in particular of domestic animals. This is fostered by discussing all subjects from a functional point of view. The lecture consists of two consecutive parts.
Objective.
751-6113-00LEndocrinology and Biology of Reproduction3 credits2VS. E. Ulbrich, S. M. Bernal Ulloa
AbstractEndokrinologie und Reproduktionsbiologie der Säugetiere und des Menschen (Anatomie, Morphologie, Physiologie, Regelmechanismen)
Die Systematik der Reproduktionshormone und der Hormonrezeptoren wird erläutert, die Wirkungsmechanismen (Bildung; orale Bioverfügbarkeit; Elimination) erklärt. Mit diesen Grundlagen wird das Verständnis der Regulation der Fortpflanzung umfassend erörtert.
ObjectiveDie Studierenden erlangen das grundlegende theoretische Verständnis und Fachwissen zur Endokrinologie der Reproduktion und zur weiblichen und männlichen Reproduktionsbiologie. Sie können darüber hinaus pathologische Situationen (Fortpflanzungsstörungen) und deren vielfältige Ursachen in den physiologischen Kontext einordnen.
751-6121-00LRegulatory Physiology Information 2 credits2VS. E. Ulbrich, M. C. Härdi-Landerer, S. Thanner
AbstractHormone und Zytokine spielen als Signalmediatoren eine besondere Rolle bei der Regulation der Homöostase von Körperfunktionen (Flüssigkeits-, Temperatur-, Energie-Homöostase, Immunität). Insbesondere im Zusammenhang mit pathologischen Konstellationen (Fieber, Stress, metabolische Imbalance, Schmerzen) wird diese komplexe Funktion verständlich. Vermittlung von Methoden zur Hormonanalytik.
ObjectiveDie Studierende werden verstehen, wie physiologische Entgleisungen entstehen und diese die am häufigsten vorkommenden gesundheitlichen Probleme in der Tierhaltung verursachen (Kälberdurchfall, Milchfieber, Ketose, Stress, Schmerz). Auf Grund des erlernten Wissens über das Zusammenwirken von humoralen und neuronalen Regelkreisen können Sie die Wirksamkeit von Einflussfaktoren und möglichen Präventionsmassnahmen beurteilen. Neben dem Vorlesungsteil ergänzen unterschiedliche Lehrmitteln wie Praxispublikationen, Expertenchats und wissenschaftliche Texte die Studierenden im eigenständigen, problemorientierten Erlernen und Bearbeiten von konkreten Fragestellungen aus Problemkreisen der Tierhaltung.
751-6125-00LPractical Course in Molecular Physiology3 credits3PS. E. Ulbrich
AbstractThis course is intended to intensify and broaden the knowledge of molecular biology gained during the bachelor lab practical course. It directly allows students to commence a master thesis with a detailed knowledge of pitfalls in experimental setup. It will also sensitize for the awareness of biological and technical variance in experimental research.
ObjectiveThe course will be divided in two parts:
Experimental part:
- Isolation of leukocytes from blood and milk (cattle)
- Culture of isolated cells and stimulation, e.g., with LPS
- Extraction of RNA
- Quantification and quality control of RNA (Nanodrop, Fluorometer, Bioanalyzer)
- Analysis of gene expression by the use of quantitative real-time RT-PCR
Theoretical part:
- Principles of primary cell culture and transcriptional regulation, methods for analytical detection
- Bioinformatics (scientific databases, sequence analysis, biostatistics)
- Presentations by the students (e.g. techniques for analysis of physiological regulatory processes, application examples)
ContentIn this practical course the students will achieve a comprehensive understanding of molecular physiology in livestock research. A cell culture experiment using blood and milk leucocytes under pathogen-associated treatment will be performed and the analysis of differential gene expression undertaken. The primary cell culture study will give insights into the laboratory work undertaken in animal physiology research. It will include the general discussion of strategies for an appropriate experimental setup in livestock research and possible methods and tools for the analysis. Hands-on cell culture and harvesting, preanalytical sample preparation and measurement implementation as well as the analysis of differential gene expression, data analysis and statistical evaluation using bioinformatics will be performed. In addition, the students will present talks based on state-of-the-art primary literature about related topics to prepare for the course and to complement the provided information. The course will enable the students to design, perform and evaluate laboratory in vitro investigations of physiological regulatory processes on a cellular level.
751-6127-00LPractical Course in Microscopy of Functional Histology3 credits6PS. E. Ulbrich
AbstractDie "Funktionelle Histologie" beschreibt die histologischen und zytologischen Strukturen mit ihren jeweiligen Aufgaben und Wechselwirkungen innerhalb ausgewählter Organsysteme. Die endokrinologisch relevanten Organe und deren Präparation werden am Beispiel des Rindes kennengelernt.
ObjectiveGrundlagen der Histologie; Gewebedünnschnitte (Gefrier- und Paraffinschnitte) und deren Übersichtsfärbungen und Immunhistochemie; Fortgeschrittene Mikroskopie von Gewebedünnschnitten; Kritische Bewertung von Physiologie/Pathologie aufgrund morphologisch/histologischer Kriterien
ContentJeder/m Studierenden wird ein Organ zugeteilt, mit welchem sie/er sich intensiv theoretisch und praktisch auseinandersetzt. Anhand dieses Organes als rotem Faden, welches vom Schlachthof bereitgestellt und von den Studierenden selber seziert, eingebettet, geschnitten, gefärbt und mikroskopiert wird, werden die Lernziele erreicht.
Die theoretischen Grundlagen werden in der Vorbereitung zum Kurs selbstständig erarbeitet. Zur Vorbereitung dient ein ausführliches Skript über die Herstellung mikroskopischer Präparate, zu Übersichtsfärbungen und zu den Prinzipien der Immunohistologie sowie zu den mikroskopischen Techniken und originäre Literatur über die Funktion des Organs in Zusammenhang mit agrarwissenschaftlichem Kontext. Die Theorie wird im Kurs im Detail vertieft und diskutiert.
Im Praktikum werden das Erstellen von Gewebedünnschnitten (Kryo- und Paraffinschnitte) und das Mikroskopieren von gefärbten und ungefärbten Gewebeschnitten selbstständig durchgeführt. Die Techniken der Übersichtsfärbungen werden angewandt und durch den Nachweis spezifischer Proteine mittels Immunhistochemie ergänzt. Die Darstellung und Erkennung von Einzelstrukturen ermöglicht ein Verständnis für das jeweils übergeordnete endokrine System, in dessen Zusammenhang das Organ steht. Pathologische Veränderungen werden Präparationsartefakten gegenübergestellt und somit eine kritische Bewertung von Beurteilungen aufgrund morphologischer Kriterien vorgenommen.

Aktivitäten: 5 Tage Praktischer Kurs mit theoretischen Einheiten, Vorbereitung der theoretischen Grundlagen im Selbststudium im Vorfeld, eine mündliche Präsentation der erhaltenen Ergebnisse und eine schriftliche Zusammenfassung (Arbeitsbericht) nach Abschluss des Kurses.
Prerequisites / NoticeIn Form eines Vortrags werden den anderen TeilnehmerInnen das zugeteilte Organ bzw Gewebe bezüglich der Morphologie, Histologie und funktioneller Gesichtspunkte vorgestellt.
In der Nachbereitung zum Praktikum wird ein Bericht angefertigt, in dem die Vorgehensweise (Verfahrensprotokoll), die Befunde (Ergebnisprotokoll) und die kritische Auseinandersetzung mit den Inhalten des Praktikums (kritische Beurteilung) dokumentiert werden.
751-6129-00LPractical Course Epigenetics3 credits6PS. E. Ulbrich
AbstractThe practical course will comprise lecture elements on introducing the topic of epigenetics in detail to you and a large amount of practical work where you will be able to perform DNA methylation analyses on your own. We will focus on DNA extraction, the estimation of Global DNA Methylation and Gene-specific Methylation.
ObjectiveThe competencies and aims for the course are as follows:
Get first hands-on experience with the experimental techniques
Answer a scientific question by conducting an experiments
Present the principle of different techniques to other students
Obtain results of an experiment and get insight into what affects technical variation and thus influences reproducibility
Interpret results in an adequate manner to solve a scientific question
Combine results to draw an adequate conclusion
Present an epigenetics research paper
Lecture notesYou will receive a draft outline of the week, the slides of the theoretical parts and a detailed protocol of the work we will do in advance of the practical course.
Prerequisites / NoticeFor receiving a total of 3 Credit Points for this practical course we kindly ask you to actively take part in the practical performance. You need to pass a 30-min written examination about the theoretical background of the techniques, approaches and the background. In addition, we ask you to present an original research paper together with a colleague. You will receive the paper in advance for preparation. We will ask you to prepare a 30 min presentation with a following discussion. Next to the presentation of your scientific paper you are asked to address questions of the presentations of your colleagues and actively take part in the discussion. Finally, we will ask you to write a lab report to be handed in at the beginning of the spring semester.