Paola Picotti: Katalogdaten im Frühjahrssemester 2022

NameFrau Prof. Dr. Paola Picotti
LehrgebietMolekulare Systembiologie
Adresse
Inst. f. Molekulare Systembiologie
ETH Zürich, HPM H 46
Otto-Stern-Weg 3
8093 Zürich
SWITZERLAND
Telefon+41 44 633 25 58
Fax+41 44 633 12 98
E-Mailpicotti@imsb.biol.ethz.ch
DepartementBiologie
BeziehungOrdentliche Professorin

NummerTitelECTSUmfangDozierende
551-0130-00LGrundlagen der Biologie II Information Belegung eingeschränkt - Details anzeigen
Belegungen über myStudies bis spätestens 2.2.2022. Spätere Belegungen werden nicht berücksichtigt.
8 KP8PM. Gstaiger, N. Aceto, J. A. Antunes Pereira, M. Cangkrama, H. Gehart, Z. Kontarakis, W. Kovacs, A. Leitner, S. L. Masneuf, P. Picotti, U. Sauer, E. B. Truernit, A. Wutz, N. Zamboni
KurzbeschreibungDieses einführende Praktikum gibt den Studenten einen Einblick in den gesamten Bereich der klassischen und modernen Biowissenschaften. Im zweiten Jahr (Praktikum GL Bio II) führt jeder Student drei Kurstage in:

- Tiermodelle
- Pflanzenbiologie
- Genomik
- Molekulare System Biologie durch.

(Total 12 Experimente)

Jeder Versuch dauert einen ganzen Tag.
LernzielEinführung in die Biologie und Erfahrung mit experimentellem Arbeiten.

Generelle Praktikumsinformation und Kursmaterialien: Moodle.

Generelle Praktikum Informationen werden auch über E-mail direkt an die Studenten verteilt (Assignment list, Instructions and Schedule & Performance Sheet).
InhaltEs werden vier Blöcke angeboten: Zellbiologie, Pflanzenbiologie, Genomik UND MolecularE System Biologie. Jeder diese Blöcke dauert 3 Wochen

TIERMODELLE:
- Tissue structure and biology
- Mouse anatomy and histology
- Tissue repair and cancer

GENOMIK:
- Chromosomenpräparation aus Säugerzellen
- Genome Editing
- Krebs Genomanalyse

MOLEKULARE SYSTEMBIOLOGIE:
- Herstellung von Proben für die Proteom- und Metabolom-Analyse
- Analyse von Proteom- und Metabolom-Daten
- Interpretation von Proteom- und Metabolom-Daten

PFLANZENBIOLOGIE:
- Phytohormone und weitere Wachstumsfaktoren
- Molekularbiologie des systemischen Gensilencing
- Langstreckentransport und Speicherung
- Literaturarbeit und Präsentation
SkriptVersuchsanleitungen

Alle Unterlagen für das Praktikum können von der Moodle Seite geladen werden.
Voraussetzungen / BesonderesBITTE BEACHTEN SIE AUCH DIE FOLGENDEN REGELN:

Ihre Anwesenheit ist an allen 12 Praktikumstagen obligatorisch. Abwesenheiten werden nur bei Vorliegen eines ärztlichen Attests akzeptiert. Arztzeugnisse (Original) müssen spätestens fünf Tage nach Absenz bei Dr. M. Gstaiger (HPM F43) abgegeben werden.

Über Ausnahmen in besonders dringenden Fällen entscheidet der Studiendelegierte des D-BIOL.

SEHR WICHTIG!!

1. Aufgrund der sehr hohen Studierendenzahlen müssen Sie das Praktikum in myStudies bis 2.2.2022 belegen.

2. Spätere Anmeldungen sind NICHT mehr möglich und können NICHT berücksichtigt werden!

3. Die Semestereinschreibung für FS22 wird vom Rektorat voraussichtlich Ende Herbstsemester 2021 freigeben. Sie bekommen ein E-Mail von Rektorat sobald Einschreibung (myStudies) freigegeben worden ist.

Über myStudies können die Studierenden sich in eine Übungsgruppe eintragen. Sobald die Lerneinheit in myStudies belegt wird, erscheint eine Textbox mit dem Hinweis, dass eine Gruppe ausgewählt werden kann. Entsprechend können die Studierenden im nächsten Schritt eine Gruppe auswählen. Falls sich mehr als 180 Studierende anmelden werden die Überzähligen auf eine Warteliste gesetzt und danach vom Praktikumsleiter eingeteilt.


Stellen Sie deshalb bereits jetzt sicher, dass Sie keine weiteren Verpflichtungen an den folgenden Praktikumstagen haben:

PRAKTIKUMSTAGE FS22 (Montag):

21.02.; 28.02.; 07.03.; 14.03.; 21.03.; 28.03.; 04.04.; 11.04.; 02.05.; 09.05.; 16.05.; 23.05.;


In den Osterferien findet kein Praktikum statt: 18.04-29.04.
551-0224-00LAdvanced Proteomics Belegung eingeschränkt - Details anzeigen
Für Masterstudierende ab 2. Semester, Doktorierende und Postdoktorierende
4 KP6GP. Picotti, L. Gillet, A. Leitner, P. Pedrioli
KurzbeschreibungZiel dieses Kurses ist es, etablierte und neue Technologien der Protein- und Proteome-Analyse kennenzulernen in Bezug auf ihre Anwendung in Biologie, Biotechnologie und Medizin.
Format: Einführung durch Dozent mit anschliessender Diskussion, unterstützt durch Literaturarbeit und Übungen.
LernzielIm Kurs werden sowohl die bereits etablierten als auch die neuesten derzeit entstehenden Technologien und Methoden in der Protein- und Proteomanlayse diskutiert im Hinblick auf ihre Anwendung in der Biologie, Biotechnologie, Medizin und Systembiologie.
InhaltBlock course teaching current methods for the acquisition and processing of proteomic datasets.
Voraussetzungen / BesonderesNumber of people: Not exceeding 30.
Students from ETHZ, Uni Zurich and University of Basel
Non-ETH students must register at ETH Zurich as special students http://www.rektorat.ethz.ch/students/admission/auditors/index_EN
551-0324-00LSystems Biology6 KP4VP. Picotti, M. Claassen, U. Sauer, B. Snijder, B. Wollscheid
KurzbeschreibungIntroduction to experimental and computational methods of systems biology. By using baker’s yeast as a thread through the series, we focus on global methods for analysis of and interference with biological functions. Illustrative applications to other organisms will highlight medical and biotechnological aspects.
Lernziel- obtain an overview of global analytical methods
- obtain an overview of computational methods in systems biology
- understand the concepts of systems biology
InhaltOverview of global analytical methods (e.g. DNA arrays, proteomics, metabolomics, fluxes etc), global interference methods (siRNA, mutant libraries, synthetic lethality etc.) and imaging methods. Introduction to mass spectrometry and proteomics. Concepts of metabolism in microbes and higher cells. Systems biology of developmental processes. Concepts of mathematical modeling and applications of computational systems biology.
Skriptno script
LiteraturThe course is not taught by a particular book, but some books are suggested for further reading:

- Systems biology in Practice by Klipp, Herwig, Kowald, Wierling und Lehrach. Wiley-VCH 2005
551-0352-00LIntroduction to Mass Spectrometry-Based Proteomics Belegung eingeschränkt - Details anzeigen
Number of participants limited to 12.

The enrolment is done by the D-BIOL study administration.
6 KP7PL. Gillet, P. Picotti
KurzbeschreibungProtein-Analyse durch Massenspektrometrie
Die folgende Thematik wird abgedeckt: Grundlagen der biologischen Massenspektrometrie einschliesslich Instrumentation, Datenaufnahme und -bearbeitung; Anwendung zur Identifizierung und Charakterisierung von Proteinen; Probevorbereitung; Proteomic-Strategien einschliesslich quantitative Analysen.
LernzielProbenvorbereitung fuer die MS Analyse (Trypsin Verdau, C18 Aufreinigung)
Prinzipien LC-MS basierter Datenaquisition (QTOF und/oder Ion Trap Instrumenten)
Qualitative Proteom Analyse (Protein Identifizierung mit Hilfe von Mascot und/oder Sequest Software)
Quantitative Proteom Analyse (unmarkierte und Isotopen markierte Strategien)
Analyse und Auswertung von Datensätzen zur Detektion von hoch- bzw. runter-regulierten Proteinen